Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc27a1Q60714 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc27a1Q60714 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms