Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sik1Q60670 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms