Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms