Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Specc1Q5SXY1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Specc1Q5SXY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms