Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms