Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med13Q5SWW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms