Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp2Q5SV77 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp2Q5SV77 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms