Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc42Q5SV66 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms