Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tns3Q5SSZ5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms