Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sft2d1Q5SSN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sft2d1Q5SSN7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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