Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf215Q5SPX3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms