Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm12185Q5NCB2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm12185Q5NCB2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms