Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms