Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttf2Q5NC05 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms