Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CoblQ5NBX1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms