Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms