Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SynaQ5G5D5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms