Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm3Q5F4S9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms