Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms