Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspb6Q5EBG6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms