Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms