Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms