Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccnl1Q52KE7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms