Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms