Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc27a5Q4LDG0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms