Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arap1Q4LDD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arap1Q4LDD4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms