Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms