Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brinp3Q499E0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brinp3Q499E0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brinp3Q499E0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brinp3Q499E0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brinp3Q499E0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Brinp3Q499E0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms