Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk4Q3V129 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms