Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700057G04RikQ3V0U0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700057G04RikQ3V0U0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms