Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms