Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms