Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BB287469Q3UT53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms