Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TceancQ3US16 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms