Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc51Q3URS9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc51Q3URS9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc51Q3URS9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms