Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms