Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp953Q3UPV7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp953Q3UPV7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms