Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam198bQ3UPI1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam198bQ3UPI1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam198bQ3UPI1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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