Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UPC7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UPC7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms