Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms