Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms