Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E330014E10RikQ3UL33 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms