Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smu1Q3UKJ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smu1Q3UKJ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms