Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms