Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms