Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Greb1Q3UHK3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms