Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef3Q3UGY8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef3Q3UGY8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms