Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms