Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms