Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms